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科学网—国外生物云平台简介

发布于2017-07-18   浏览152次   评论0条  

晚近,跟随高通量测序技术的迅捷开展,,遗传履历呈演奏者增长。,高通量测序履历库SRA(NCBI防守)为例,2009年度履历包孕10TB2011年在附近100TB2014年又年骰子。1PB2015年在附近5PB2016这年有成功希望的人打破。10PB。依赖于当地人服侍与专业生信辨析全体员工的惯例履历辨析形式先前难以心甘情愿的这一大履历树立下的生物工艺学运动场探讨。以任何方式高效、短时间做成的运用这些大履历,为生命迷信预备无穷时机。即使,以任何方式辨析和敷用也产品了崭新的应战,生物云计算便能健康的的处置这些成绩。诸如,异国DNAnexusSevenBridges安心平台,此外海内BGIonline(华大孟德尔基因)BMKCloud(百迈客)安心平台。上面引见稍微海内外观云际生物大履历敷用中对照有影响力的生物云平台。

1 DNAnexus

       DNANexus专注于安排云计算服侍。DNA履历库,履历库是经过探讨全体员工和迷信家预备办事。目的是可以贮存更多的孟德尔基因入云,手巧的避难所与孟德尔基因对照辨析。该文字还预备了人类遗传履历支持,孟德尔基因搜索与合营公司。经过检索和合营公司,资料暂存器可以从数以百万计的遗传论被发现的人药物的病人数的任务。眼前 DNAnexus 用户已包孕斯坦福大学和哈佛大学,制药业公司,稍微资料暂存器也会经过。DNA疾病诊断教训。DNAnexus与谷歌举行技术合作,预备最片面的DNA履历库,它可以经过资格生物工艺学教训中心。NCBI)下SRA对这些网站的拜访DNA履历。履历将被兼并为DNANexusDNA历史文献教训,并内存在谷歌的云计算服侍中,探讨全体员工现时可以不紧张地拜访。这是谷歌云计算服侍中最大的第三方履历。。

2Seven Bridges Genomics

SevenBridges Genomics人类弊病孟德尔染色体组探讨和药物业的首要预备者,生物教训目测,履历辨析等。。Seven Bridges Genomics在人类孟德尔染色体组测序和辨析中,云计算和NoSQL履历技术,譬如EC2S3MongoDB

3BaseSpace

       Illumina最新时代指画生物家的定序云计算平台——BaseSpaceBaseSpace云敷用软件的运用,生物教训学辨析,有助于自动行为化。BaseSpace眼前本身6独立的履历辨析敷用程序:重测序、振幅子测序、16S宏孟德尔染色体组、de novo拆卸、小分子RNA和藏书QC。敷用Illumina Experiment ManagerIllumina试验取得),表设置中所需范本的选择辨析,采取军事行动开端后,履历直地转移到BaseSpace。一旦测序运转,取得,BaseSpace标明启动举措的自动行为辨析,离用户发生关系。

4galaxy

     Galaxy是任何人吐艳的因为用网覆盖的生物教训学平台。经过平台,在不d的事先准备下对杂多的生物教训举行辨析,能记载每一步的辨析转换,同时,您可以共享辨析和任务流的历史。。可认为我们的预备内存资源和计算转换辨析办事。,它集成了多种生物教训学辨析器,可以是助手和手巧的的生物履历辨析任务流取得零碎的安排,履历搜集,检索和处置、序列比对的拆卸、序列辨析、SNP/WGA辨析、履历目测和数量庞大的数量庞大的安心的生物教训辨析效能。

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